Laboratoire des Procédés Biologiques, Génie Enzymatique et Microbien    Français English

Plateforme de bioinformatique

L'objectif de la plateforme de bioinformatique de ProBioGEM est de développer et promouvoir l'exploitation des outils bioinformatiques pour optimiser l'obtention sélective de peptides actifs. Elle a été initialement construite autour de la base de données Norine (http://bioinfo.lifl.fr/norine) à laquelle d'autres outils ont été ajoutés permettant par exemple de prédire la structure ou l'activité des peptides nonribosomiques.


Norine


Collaborations :

  • Equipe Bonsai du LIFL (Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille), Université de Lille 1, INRIA Lille Nord Europe : Maude Pupin, Laurent Noé.
  • Equipe Orpailleur du LORIA (Laboratoire Lorrain d'Informatique et ses application), Université de Lorraine, INRIA Nancy Grand Est : Marie-Dominique Devignes, Malika Smaïl-Tabbone.

Workshop :

Organisation d'un workshop international "BIOINFORMATIC TOOLS FOR PKS and NRPS DISCOVERY : From genomic data to the products" qui s'est tenu du 10 au 12 Juillet 2013 à Villeneuve d'Ascq (Université de Lille1) : 30 participants, 12 nationalités, 3 continents